Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd3Q61060 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd3Q61060 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd3Q61060 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Foxd3Q61060 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Foxd3Q61060 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Foxd3Q61060 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd3Q61060 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms