Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift20Q61025 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift20Q61025 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ift20Q61025 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift20Q61025 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift20Q61025 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms