Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klf3Q60980 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klf3Q60980 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klf3Q60980 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klf3Q60980 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms