Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vdac1Q60932 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vdac1Q60932 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vdac1Q60932 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms