Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Neurod1Q60867 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Neurod1Q60867 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Neurod1Q60867 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Neurod1Q60867 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Neurod1Q60867 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms