Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf8Q60846 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf8Q60846 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf8Q60846 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf8Q60846 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms