Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClpbQ60649 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClpbQ60649 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ClpbQ60649 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ClpbQ60649 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClpbQ60649 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClpbQ60649 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClpbQ60649 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClpbQ60649 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ClpbQ60649 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ClpbQ60649 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ClpbQ60649 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ClpbQ60649 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ClpbQ60649 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ClpbQ60649 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClpbQ60649 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClpbQ60649 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpbQ60649 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpbQ60649 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpbQ60649 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ClpbQ60649 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpbQ60649 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpbQ60649 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpbQ60649 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpbQ60649 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClpbQ60649 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ClpbQ60649 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms