Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Xrcc1Q60596 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Xrcc1Q60596 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xrcc1Q60596 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms