Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf123Q5XPI3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf123Q5XPI3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf123Q5XPI3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rnf123Q5XPI3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms