Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uimc1Q5U5Q9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uimc1Q5U5Q9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uimc1Q5U5Q9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Uimc1Q5U5Q9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uimc1Q5U5Q9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uimc1Q5U5Q9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Uimc1Q5U5Q9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uimc1Q5U5Q9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uimc1Q5U5Q9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Uimc1Q5U5Q9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uimc1Q5U5Q9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uimc1Q5U5Q9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Uimc1Q5U5Q9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uimc1Q5U5Q9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uimc1Q5U5Q9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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