Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdcp1Q5U462 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdcp1Q5U462 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdcp1Q5U462 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdcp1Q5U462 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdcp1Q5U462 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms