Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CluhQ5SW19 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CluhQ5SW19 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CluhQ5SW19 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CluhQ5SW19 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CluhQ5SW19 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms