Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc42Q5SV66 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc42Q5SV66 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc42Q5SV66 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc42Q5SV66 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms