Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930512M02RikQ5SQK8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
4930512M02RikQ5SQK8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930512M02RikQ5SQK8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930512M02RikQ5SQK8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms