Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cacna2d4Q5RJF7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cacna2d4Q5RJF7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cacna2d4Q5RJF7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms