Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH2

Unkl, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UNKL, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UnklQ5FWH2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UnklQ5FWH2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UnklQ5FWH2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UnklQ5FWH2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UnklQ5FWH2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UnklQ5FWH2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UnklQ5FWH2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms