Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sfmbt2Q5DTW2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sfmbt2Q5DTW2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms