Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam208bQ5DTT3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam208bQ5DTT3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam208bQ5DTT3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam208bQ5DTT3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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