Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmtc2Q56A06 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmtc2Q56A06 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tmtc2Q56A06 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmtc2Q56A06 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmtc2Q56A06 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms