Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA53

Pds5b, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5bQ4VA53 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Pds5bQ4VA53 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Pds5bQ4VA53 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Pds5bQ4VA53 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Pds5bQ4VA53 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Pds5bQ4VA53 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Pds5bQ4VA53 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Pds5bQ4VA53 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Pds5bQ4VA53 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Pds5bQ4VA53 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
Pds5bQ4VA53 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Pds5bQ4VA53 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Pds5bQ4VA53 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Pds5bQ4VA53 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Pds5bQ4VA53 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC41■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Pds5bQ4VA53 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Pds5bQ4VA53 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Pds5bQ4VA53 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Pds5bQ4VA53 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Pds5bQ4VA53 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Pds5bQ4VA53 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Pds5bQ4VA53 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Pds5bQ4VA53 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Pds5bQ4VA53 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Pds5bQ4VA53 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Pds5bQ4VA53 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
Pds5bQ4VA53 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Pds5bQ4VA53 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
Pds5bQ4VA53 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
Pds5bQ4VA53 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Pds5bQ4VA53 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Pds5bQ4VA53 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Pds5bQ4VA53 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Pds5bQ4VA53 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Pds5bQ4VA53 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms