Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trp53i11Q4QQM4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trp53i11Q4QQM4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trp53i11Q4QQM4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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