Protein–RNA interactions for Protein: Q4PJX1

Odr4, Protein odr-4 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odr4Q4PJX1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Odr4Q4PJX1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Odr4Q4PJX1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Odr4Q4PJX1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Odr4Q4PJX1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Odr4Q4PJX1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odr4Q4PJX1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odr4Q4PJX1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odr4Q4PJX1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odr4Q4PJX1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odr4Q4PJX1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odr4Q4PJX1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odr4Q4PJX1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Odr4Q4PJX1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odr4Q4PJX1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odr4Q4PJX1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Odr4Q4PJX1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Odr4Q4PJX1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms