Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDF6

Cfhr2, Complement factor H-related 2, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfhr2Q4LDF6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfhr2Q4LDF6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfhr2Q4LDF6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfhr2Q4LDF6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfhr2Q4LDF6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfhr2Q4LDF6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfhr2Q4LDF6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfhr2Q4LDF6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfhr2Q4LDF6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfhr2Q4LDF6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfhr2Q4LDF6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfhr2Q4LDF6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cfhr2Q4LDF6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cfhr2Q4LDF6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfhr2Q4LDF6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfhr2Q4LDF6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms