Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Krtap1-4Q3V2D6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Krtap1-4Q3V2D6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Krtap1-4Q3V2D6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms