Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930596D02RikQ3V0H9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms