Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmed1Q3V009 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmed1Q3V009 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed1Q3V009 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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