Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm28047Q3US59 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm28047Q3US59 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm28047Q3US59 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms