Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Prrc1Q3UPH1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrc1Q3UPH1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrc1Q3UPH1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrc1Q3UPH1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms