Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmi2Q3UPE3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmi2Q3UPE3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmi2Q3UPE3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmi2Q3UPE3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rmi2Q3UPE3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rmi2Q3UPE3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rmi2Q3UPE3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rmi2Q3UPE3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rmi2Q3UPE3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rmi2Q3UPE3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rmi2Q3UPE3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rmi2Q3UPE3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmi2Q3UPE3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rmi2Q3UPE3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms