Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek10Q3UGM2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek10Q3UGM2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek10Q3UGM2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek10Q3UGM2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms