Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zyg11bQ3UFS0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zyg11bQ3UFS0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zyg11bQ3UFS0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zyg11bQ3UFS0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zyg11bQ3UFS0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Zyg11bQ3UFS0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms