Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nom1Q3UFM5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nom1Q3UFM5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nom1Q3UFM5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nom1Q3UFM5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nom1Q3UFM5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nom1Q3UFM5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nom1Q3UFM5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nom1Q3UFM5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nom1Q3UFM5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nom1Q3UFM5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nom1Q3UFM5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nom1Q3UFM5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nom1Q3UFM5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nom1Q3UFM5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nom1Q3UFM5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nom1Q3UFM5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nom1Q3UFM5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nom1Q3UFM5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nom1Q3UFM5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nom1Q3UFM5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nom1Q3UFM5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nom1Q3UFM5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms