Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LbrQ3U9G9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LbrQ3U9G9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LbrQ3U9G9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LbrQ3U9G9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LbrQ3U9G9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms