Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5C7

Prickle1, Prickle-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prickle1Q3U5C7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prickle1Q3U5C7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prickle1Q3U5C7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prickle1Q3U5C7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prickle1Q3U5C7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prickle1Q3U5C7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prickle1Q3U5C7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prickle1Q3U5C7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prickle1Q3U5C7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prickle1Q3U5C7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prickle1Q3U5C7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prickle1Q3U5C7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prickle1Q3U5C7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms