Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CenplQ3U3S3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenplQ3U3S3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenplQ3U3S3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenplQ3U3S3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenplQ3U3S3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms