Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gse1Q3U3C9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gse1Q3U3C9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gse1Q3U3C9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gse1Q3U3C9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gse1Q3U3C9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms