Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc174Q3U155 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc174Q3U155 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc174Q3U155 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc174Q3U155 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc174Q3U155 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc174Q3U155 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc174Q3U155 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc174Q3U155 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc174Q3U155 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc174Q3U155 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc174Q3U155 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc174Q3U155 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc174Q3U155 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc174Q3U155 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc174Q3U155 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc174Q3U155 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc174Q3U155 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms