Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc17a7Q3TXX4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc17a7Q3TXX4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc17a7Q3TXX4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc17a7Q3TXX4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms