Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q3TQQ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q3TQQ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q3TQQ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q3TQQ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q3TQQ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q3TQQ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q3TQQ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q3TQQ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q3TQQ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q3TQQ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q3TQQ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q3TQQ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q3TQQ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q3TQQ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q3TQQ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q3TQQ9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q3TQQ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q3TQQ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q3TQQ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms