Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnfaip8l3Q3TBL6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfaip8l3Q3TBL6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfaip8l3Q3TBL6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms