Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa26Q3L180 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa26Q3L180 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Defa26Q3L180 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa26Q3L180 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms