Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Col24a1Q30D77 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col24a1Q30D77 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col24a1Q30D77 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Col24a1Q30D77 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col24a1Q30D77 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms