Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Samd11Q1RNF8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Samd11Q1RNF8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Samd11Q1RNF8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Samd11Q1RNF8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms