Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd300lgQ1ERP8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd300lgQ1ERP8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300lgQ1ERP8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd300lgQ1ERP8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300lgQ1ERP8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300lgQ1ERP8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300lgQ1ERP8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300lgQ1ERP8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300lgQ1ERP8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300lgQ1ERP8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300lgQ1ERP8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300lgQ1ERP8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300lgQ1ERP8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300lgQ1ERP8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms