Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cers3Q1A3B0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cers3Q1A3B0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cers3Q1A3B0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cers3Q1A3B0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cers3Q1A3B0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cers3Q1A3B0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cers3Q1A3B0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cers3Q1A3B0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cers3Q1A3B0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cers3Q1A3B0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cers3Q1A3B0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cers3Q1A3B0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cers3Q1A3B0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cers3Q1A3B0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cers3Q1A3B0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms