Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ptchd1Q14B62 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ptchd1Q14B62 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ptchd1Q14B62 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ptchd1Q14B62 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms