Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpusd3Q14AI6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpusd3Q14AI6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpusd3Q14AI6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd3Q14AI6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd3Q14AI6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms