Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VgfQ0VGU4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VgfQ0VGU4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VgfQ0VGU4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VgfQ0VGU4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VgfQ0VGU4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VgfQ0VGU4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VgfQ0VGU4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VgfQ0VGU4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VgfQ0VGU4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VgfQ0VGU4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VgfQ0VGU4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VgfQ0VGU4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VgfQ0VGU4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VgfQ0VGU4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VgfQ0VGU4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms