Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Samd12Q0VE29 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Samd12Q0VE29 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Samd12Q0VE29 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms