Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itgb8Q0VBD0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itgb8Q0VBD0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms